Long-read sequencing with targeted assembly of the opsin locus accurately evaluates genes in expressed positions
该研究利用纳米孔长读长测序结合靶向组装技术，克服了传统方法在分析高度相似的视蛋白基因簇时的局限，实现了对红绿色盲基因拷贝数、排列顺序及携带者状态的精准检测与表型解析。
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genetic and genomic medicine
189 篇论文
Comprehensive detection of genetic and epigenetic alterations in cancer using long reads with TumorLens
该论文介绍了 TumorLens，这是首个能够利用长读长测序技术在单次检测中统一分析单核苷酸变异、插入缺失、结构变异、拷贝数变异、杂合性缺失及 DNA 甲基化等多组学特征的癌症基因组框架，从而为精准肿瘤学提供了全面且标准化的肿瘤谱系分析新标准。
The Externalizing Spectrum and Suicide Risk: Insights from Genomics and Electronic Health Records in over 500,000 Veterans
这项基于超过 50 万名退伍军人数据的研究表明，外化行为谱系（如物质使用障碍和 ADHD）与自杀风险之间存在显著的遗传重叠和前瞻性关联，提示外化障碍是预测自杀相关结局的重要指标。
Local ancestry modulates gene expression: shifting our understanding of genetic regulation and disease association within and across populations
该研究通过构建新的统计框架，揭示了在 Hispanic/Latino 和非洲裔美国人群中局部祖先背景对基因表达的普遍调节作用，阐明了跨人群基因组研究结果不一致的机制，并强调了在精准医学中整合局部基因组背景以解决健康差异的重要性。
The GBA1 p.E427K (p.E388K) Variant is a Risk Factor for Synucleinopathies: A Meta-Analysis
这项荟萃分析证实，GBA1 p.E427K（p.E388K）变异是帕金森病等突触核蛋白病的显著遗传风险因素，其风险效应与已知的 GBA1 致病突变相当，并伴有酶活性降低。
Trio-based GWAS reveals novel loci associated with different forms of isolated cleft lip
该研究通过对 837 个非综合征性唇裂（CL）家系进行全基因组测序和精细表型分析，利用基于三联体的全基因组关联扫描发现了四个显著位点，其中 IRF6 和 8q24.21 与整体唇裂相关，而 PLCB1/PLCB4 和 MAFB 则分别特异性地关联于牙槽突受累和唇裂左侧偏侧性，从而证实了精细的亚型分层对于揭示唇裂异质性遗传机制的重要性。
Clustering of major depressive disorder genetic instruments identifies distinct and directionally opposing effects on cardiometabolic risk
该研究利用聚类孟德尔随机化方法，识别出抑郁症遗传变异可划分为三个具有不同生物学机制的亚群，其中两个亚群通过神经精神相关通路增加 2 型糖尿病及代谢风险，而另一个亚群则通过脂肪酸代谢等途径降低相关风险，揭示了抑郁症遗传异质性对心血管代谢健康的双向影响。
Long-read sequencing reveals diverse haplotypes and common structural variants in Alzheimer's Disease GWAS loci
该研究利用长读长测序技术结合表观遗传学分析与基因型填补策略，系统解析了阿尔茨海默病全基因组关联分析位点中的复杂单倍型结构，鉴定出包括转座子和串联重复在内的多种结构变异，并揭示其中部分变异通过调控基因表达或染色质组织成为疾病风险的关键驱动因素。
CoNVict: An Agentic AI System for Copy Number Variation Prioritization in Rare Disease Diagnosis
本文介绍了 CoNVict，一种基于智能体 AI 的双阶段系统，它通过结合裁决分类和锦标赛排名机制，有效解决了拷贝数变异（CNV）在罕见病诊断中从自动化注释到患者特异性临床推理的差距，显著提升了致病 CNV 的识别能力。
Proteome-wide Mendelian randomization implicates TIMP2 as a putative causal protein for bone mineral density and fracture risk
这项研究通过大规模蛋白质组孟德尔随机化分析，鉴定出 18 种与骨密度和骨折风险存在因果关系的循环蛋白，并特别强调组织金属蛋白酶抑制剂 2（TIMP2）的高水平是降低骨密度和增加骨折风险的潜在因果因素，使其成为治疗骨质疏松症的新靶点。
Genome-wide association meta-analyses over one million individuals identify 54 loci associated with urinary incontinence and its subtypes
这项基于超过 100 万人的全基因组关联荟萃分析研究，鉴定了 54 个与尿失禁及其亚型相关的遗传位点（其中 52 个为新发现），揭示了不同亚型涉及的特定组织与通路，并确定了吸烟、高 BMI、多产、盆腔器官脱垂及良性前列腺增生等关键因果风险因素。
Recent positive selection implicates IP6K3 and MAPT as metabolically relevant loci in South Asians
该研究通过整合近期正选择信号与跨性状遗传关联数据，在南亚人群中鉴定出包括 IP6K3 和 MAPT 在内的四个与 2 型糖尿病代谢相关的关键基因位点，并为在代表性不足的人群中开展基因发现建立了一个可扩展的框架。
Multi-trait and Gene-Based Analyses Identify Genetic Variants Associated with Spontaneous Coronary Artery Dissection
该研究通过整合多性状全基因组关联分析、基因基础测试及功能注释，成功鉴定出 40 个自发性冠状动脉夹层（SCAD）相关遗传位点和 56 个关键基因，揭示了除细胞外基质组织外涉及动脉壁完整性、血管活性张力及凝血机制的生物学通路，为 SCAD 的风险分层和实验研究提供了新靶点。
Application of deep learning and explainable AI-supported medical decision-making for facial phenotyping in genetic syndromes
该研究评估了基于显著性的可解释人工智能（XAI）在遗传综合征面部表型识别中的应用，发现虽然 AI 预测概率能显著提升遗传学家的诊断准确性与信心，但 XAI 解释（如显著性图）并未被有效整合进决策过程，反而因评价较低而未带来额外的准确性或信心增益。
Genome-wide association studies identify 77 loci for suicidality and provide novel biological insights
该研究通过对多祖先群体进行大规模全基因组关联分析，鉴定出 77 个与自杀意念、尝试及死亡相关的显著基因位点，揭示了其多基因遗传特性及涉及突触通路和特定脑区神经元的生物学机制。
Dissecting the relationship between haplotypes around ATXN2 CAG repeats and the number of CAA interruptions by long-read sequencing
该研究利用长读长测序技术发现，ATXN2 基因中间长度 CAG 重复序列中的三个 CAA 中断在健康人群中罕见但在肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者中高频出现，且欧洲裔人群中特定的 SNP（rs148019457）可作为携带该中断单倍型的特异性标记，为神经系统疾病的精准基因组医学提供了新见解。
Shared effector genes of insomnia, anxiety and depression implicate synaptic processes as transdiagnostic drug targets
该研究通过多水平三变量遗传分析框架，揭示了失眠、焦虑和抑郁共享的遗传风险主要源于突触过程，并鉴定出 CACNA2D3、DRD2、GRIA1 和 GRM5 等作为跨诊断治疗靶点的潜在药物开发候选基因。
Sex-Specific Genetic Architecture and Comorbidities of Alcohol Use Behaviors
该研究通过大规模性别分层全基因组关联分析，揭示了酒精使用行为在遗传架构、特定基因位点及共病特征上存在显著的性别差异，表明纳入性别视角的分析能更精准地阐明酒精使用的遗传病因及其对健康结局的影响。
Radiological Evaluation of the Natural History of PIK3CA-Related Overgrowth Spectrum (PROS)
这项针对 30 名 PIK3CA 相关过度生长谱（PROS）患者的多中心研究首次通过影像学描述了该病的自然病程，发现绝大多数患者的病灶体积随时间推移呈持续性增大，且这种进展可持续至成年期。
Characterising the motif composition and allele length distribution of ZFHX3 GGC repeat expansions in amyotrophic lateral sclerosis
该研究通过对大量肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者和对照组的分析，发现 ZFHX3 基因中的 GGC 重复扩增与 ALS 风险无显著关联，但揭示了该重复序列具有高度动态的基序组成和等位基因长度分布特征，提示在评估神经退行性疾病风险时需综合考虑重复序列的基序构成。