PAVS: A Standardized Database of Phenotype-Associated Variants from Saudi Arabian Rare Disease Patients
本文介绍了 PAVS 数据库，这是一个整合了沙特阿拉伯及国际队列临床数据、采用标准化表型编码的知识库，旨在填补特定人群基因型 - 表型资源的空白并提升罕见病致病基因的优先排序能力。
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genetic and genomic medicine
121 篇论文
遗传与基因组医学正在重塑我们理解生命与疾病的方式，它通过解读我们的遗传密码来探索健康背后的深层机制。这一领域不仅关乎个人基因特征的差异，更致力于发现疾病根源并开发精准的预防与治疗策略，让医疗从“千人一方”走向“量身定制”。
在 Gist.Science 上，我们直接对接 medRxiv 预印本服务器，第一时间收录该领域的最新研究成果。团队会对每一份新上传的论文进行处理，提供通俗易懂的科普解读以及详尽的技术摘要，帮助读者跨越专业术语的障碍，快速把握科学前沿。
以下为您精选了近期在遗传与基因组医学领域发布的最新预印本论文。
Genomic ascertainment of PALB2-related cancer predisposition
该研究通过英国生物样本库和 Geisinger MyCode 两个大型人群队列的基因组筛查发现，携带 PALB2 致病性杂合变异的个体患多种癌症（特别是乳腺癌和胰腺癌）的风险及全因死亡率均显著升高，尽管其风险估计值低于基于家族史筛选的研究结果，且受家族癌症史的影响。
Functionality-Informed Fine-Mapping Dissects Common Variant Contributions to Coronary Artery Disease and Identifies Causal Variants and Pathways
该研究利用基于功能的 SBayesRC 贝叶斯精细定位框架，对超过一百万欧洲血统个体的冠状动脉疾病全基因组关联数据进行分析，揭示了该疾病的高度多基因架构，确定了 36 个高置信度因果变异及其对应的关键基因（如 PHACTR1、APOE 和 LPL），并阐明脂蛋白功能、血管稳态及细胞应激与炎症是驱动冠心病遗传风险的核心生物学通路。
Sex-specific dissection of adiposity genetics reveals distinct pathways to endometrial cancer risk
这项研究通过对 200 万人的数据进行分析，首次揭示了女性特异性肥胖遗传因素通过激素反应和致癌通路显著增加子宫内膜癌风险，并阐明了肥胖相关与独立遗传机制在疾病易感性中的不同作用。
Assessing the clinical significance of a novel rare variant in Loeys-Dietz Syndrome by combining AI-driven modelling and cell biology
本研究通过结合 AI 驱动的分子建模与体外细胞实验，证实了 TGFBR2 基因中的新型罕见变异 E431K 会破坏蛋白稳定性并导致 TGF-β信号通路异常，从而确诊该患者为洛伊斯 - 迪茨综合征 2 型。
The Power of Partnership: Democratizing Genetic Prevalence to Empower Patient Advocacy
该研究通过与 18 个罕见病患者组织合作，利用 gnomAD 数据库开发了公开工具 GeniE 来估算 22 种常染色体隐性遗传病的遗传患病率，强调了患者参与对动态更新数据及赋能罕见病倡导的重要性。
Genome-Wide Variations of End Motif in Cell-Free DNA Fragments Distinguish Immunotherapy Responders from Non-Responders in Head and Neck Cancer: A Multi-Institute Prospective Study
这项多中心前瞻性研究开发了一种名为区域基序多样性评分（rMDS）的新型 cfDNA 片段组学指标，通过量化 cfDNA 5'端末端基序的熵变，成功区分了头颈鳞状细胞癌免疫治疗患者的响应情况，其预测性能优于现有标志物，并揭示了末端基序动态变化与肿瘤免疫互作及端粒生物学的潜在联系。
FRMPD4, a causal gene for intellectual disability and epilepsy, is associated with X-linked non-syndromic hearing loss
该研究通过人类家系遗传分析及跨物种功能验证，证实 FRMPD4 基因突变不仅导致智力障碍和癫痫，也是非综合征性听力损失的致病原因，从而拓展了该基因的表型谱并确立了其在听觉功能中的进化保守作用。
Genetic influence of BCAA metabolism on type 2 diabetes and coronary artery disease, independent of traditional risk factors
该研究通过跨人群基因组结构方程建模，首次证实支链氨基酸代谢对2型糖尿病和冠心病的影响独立于肥胖及血脂等传统风险因素，揭示了其作为潜在治疗靶点的临床价值。
Diagnostic Accuracy of Large Language Models for Rare Diseases: A Systematic Review and Meta-Analysis
本系统评价与荟萃分析显示，尽管引入外部知识的大语言模型在罕见病诊断中表现优于独立模型，但现有研究普遍存在高偏倚风险且缺乏前瞻性临床验证，表明在临床部署前亟需建立基于患病率分层的评估基准并开展独立的前瞻性研究。